琼海市疾病预防控制中心坐落于美丽的万泉河畔，嘉积镇新海路，系全额编制副科级事业单位，是市疾病预防控制与卫生监测检验监测技术指导中心，承担全市传染病监测和控制、免疫规划、公共卫生突发事件处理和重大灾害防疫、健康相关产品的检验检测、鉴定和卫生学评价、健康教育与健康促进爱国卫生技术指导等任务。
中心坚持把公共卫生服务能力建设作为重点工作来抓，根据工作实际制定疾控服务能力建设规划，精心组织实施，建立健全工作责任制度，中心主要领导负总责任，指定分管领导具体负责，分步实施，重点突破，整体推进，确保各项建设目标、任务和措施落实到位。目前，全中心设有办公室、应急办公室、急性传染病预防控制组、免疫规划组、结核病预防控制组、公共卫生组、检验组、健康教育组、病媒生物监测与寄生虫病地方病预防控制组、后勤保障组、预防医学咨询服务部等11个内设机构。疾控中心建设标准要求，设主任1名，副主任3名（目前配置了一正三副），中心现有职工91名。